Facteurs de transcription
Les facteurs de transcription sont des protéines qui se lient à des séquences d'ADN spécifiques afin de réguler l'expression d'un gène donné. Il existe environ 1 400 facteurs de transcription chez l'homme ; leur interaction active ou réprime de vastes répertoires de gènes cibles en aval. Un contrôle réglementaire étroit est obtenu grâce à la nature hautement dynamique des facteurs de transcription et des combinaisons distinctes de TF, permettant à un nombre relativement faible de TF de générer une grande diversité de types de cellules. Il existe de nombreux mécanismes différents pour contrôler l'activité d'un facteur de transcription. Ces mécanismes comprennent le contrôle de la localisation de la protéine ou le contrôle de la capacité de la protéine à se lier à l'ADN.
Facteurs de transcription généraux
On distingue les facteurs de transcription généraux (basaux) et les facteurs de transcription spécifiques à un gène. Les facteurs de transcription généraux, se lient soit directement à l'ADN, par exemple à des motifs généraux comme les éléments promoteurs, à l'ARN polymérase, ou à d'autres protéines du complexe de préinitiation. Ils sont nécessaires pour que l'ARN polymérase fonctionne sur un site de transcription chez les eucaryotes. Certains ont des sites de liaison pour d'importants régulateurs (par exemple, les antiterminateurs), d'autres ont des fonctions de protéine kinase ou présentent une activité hélicase. Ils sont ubiquitaires et n'ont généralement aucun rôle dans la régulation spécifique des gènes.
Environ 15 % de tous les gènes humains sont régulés par Myc. Myc recrute des facteurs d'élongation mais peut également agir comme un répresseur transcriptionnel. Les protéines Myc activent l'expression de nombreux gènes pro-prolifératifs en liant des séquences de boîtes d'extension et en recrutant des histones acétyltransférases. L'expression constitutive de c-MYC contribue à la formation de tumeurs. Les gènes myc constituent donc une cible très pertinente pour leur traitement.
Facteurs de transcription spécifiques
Les facteurs de transcription spécifiques d'une séquence sont considérés comme les mécanismes les plus importants et les plus divers de la régulation des gènes dans les cellules procaryotes et eucaryotes. Les facteurs de transcription spécifiques indiquent à la polymérase quel gène activer. Ils ne sont donc présents que dans les cellules où le gène qu'ils régulent doit être activé ou réprimé. Les régions de l'ADN auxquelles ils se lient ont une séquence spécifique, comme les amplificateurs ou les silencieux, qui est reconnue et liée par le facteur de transcription. Les facteurs de transcription spécifiques sont généralement activés par des protéines kinases. L'activation est la fin d'une longue chaîne de transduction du signal déclenchée par un récepteur, généralement par la méthylation du TF. La méthylation déclenche la translocation vers le noyau où ils peuvent interagir avec leurs amplificateurs correspondants. Si le TF est déjà dans le noyau des modifications post-traductionnelles peuvent permettre l'interaction avec des facteurs de transcription partenaires.
Anti-corps contre CREB1
Anticorps contre NFATC1
Anticorps contre NF-kB
Anticorps contre MYOD1
Anticorps contre p53
Anticorps contre les protéines CDX
Régulation des facteurs de transcription
- Liaison des ligands (hormones stéroïdiennes).
- Phosphorylation (activités kinases)
- maturation (domaines des récepteurs ancrés dans la membrane).
- Concentration (les faibles concentrations activent, les fortes inhibent la réponse).
- Liaison des cofacteurs (la liaison des cofacteurs inhibe la transcription).
- Formation d'hétérodimères (seuls les complexes activent les promoteurs).
- Liaison à l'ADN
- Blocage du site de liaison de l'ADN (ligand).
- Déplacement du site de liaison à l'ADN
Cofacteurs
Les éléments cis-régulateurs cardinaux dictent le recrutement sélectif de cofacteurs à des promoteurs spécifiques, établissant ainsi un code de corégulation qui serait largement distinctif de chaque motif cardinal et sous-ensemble de promoteurs défini par ces éléments. Les cofacteurs (remodeleurs de chromatine, enzymes modificatrices d'histones/protéines et protéines d'échafaudage) organisent la structure locale de la chromatine et coordonnent l'équilibre des modifications post-traductionnelles à proximité, contribuant ainsi à la régulation globale de la transcription.
Facteurs de transcription et cofacteurs comme cibles médicamenteuses prometteuses
Parce que les facteurs de transcription et leurs cofacteurs respectifs contrôlent de nombreux processus biologiques différents, ils sont impliqués dans le développement de dans une variété de maladies et de troubles. Les mutations des gènes des coactivateurs entraînant la perte ou le gain de la fonction de la protéine ont été liées à des anomalies congénitales, au cancer (en particulier les cancers hormono-dépendants), aux troubles du développement neurologique et à la déficience intellectuelle (DI), entre autres. Les coactivateurs sont des cibles prometteuses pour les thérapies médicamenteuses, le remplacement par un ligand synthétique permettant de contrôler une augmentation ou une diminution de l'expression génétique. Antibodies-online propose des anticorps contre une variété de facteurs de transcription et de cofacteurs pour vos recherches. Une sélection est présentée sur ce site si votre cible est manquante, contactez notre équipe de biologistes pour vous aider via le chat, le formulaire de contact ou l'e-mail.
Anticorps contre les cofacteurs transcriptionnels
References
: "Myc transcription factors: key regulators behind establishment and maintenance of pluripotency." dans: Regenerative medicine, Vol. 5, Issue 6, pp. 947-59, (2011) (PubMed).: "Combinatorial function of transcription factors and cofactors." dans: Current opinion in genetics & development, Vol. 43, pp. 73-81, (2018) (PubMed).
: "Competition between histone and transcription factor binding regulates the onset of transcription in zebrafish embryos." dans: eLife, Vol. 6, (2018) (PubMed).
: "Inferring condition-specific targets of human TF-TF complexes using ChIP-seq data." dans: BMC genomics, Vol. 18, Issue 1, pp. 61, (2017) (PubMed).
: "Targeting Transcription Factors for Cancer Treatment." dans: Molecules (Basel, Switzerland), Vol. 23, Issue 6, (2018) (PubMed).